바렛 식도의 치료 목표는 위식도 역류를 감소시키고, 점막병변을 치료하는 것이며 궁극적으로 바렛 식도에서 식도 선암으로의 진행을 예방하는 것입니다. 바렛 식도의 치료는 일반적으로 역류성 식도염에서 시행하는 약물치료와 크게 다르지 않습니다. 대표적인 약물로는 프로톤 펌프 억제제(Proton pump inhibitor, PPI)인 위산 분비 억제제가 많이 사용됩니다. 프로톤 펌프 억제제는 1회 용량으로 24시간 산 분비를 90%까지 억제할 수 있는 강력한 약제로 역류 증상을 치료하는 데 사용되며 히스타민 수용체 차단제와 같은 다른 약제보다 위식도 역류를 줄이는데 효과가 있습니다. 보통 역류 증상은 프로톤 펌프 억제제 투여로 잘 치료되지만 그렇다고 약물치료 단독으로 바렛 식도의 병변 길이를 짧아지게 할 수 없고, 바렛 식도가 이형성이나 선암으로 진행하는 것을 예방할 수 없습니다. 현재로서는 식도 선암의 예방하기 위해 약물치료를 장기적으로 유지하지는 않습니다.
만약 약물치료에 반응하지 않거나 합병증이 동반된 경우 수술적 치료를 고려하게 됩니다. 위저부를 이용하여 식도 주위를 둘러싸는 항역류수술(위저부주름술)로 하부 식도압을 증가시킬 수 있습니다. 하지만 항역류수술을 통한 위식도역류 예방이 약물치료보다 식도 선암 예방에 효과적이라는 보고는 아직 없습니다. 만약 조직검사에서 고등급의 이형성이나 점막에 국한된 암이 동반된 바렛 식도의 경우에는 외과적 절제술을 고려해 볼 수 있습니다. 전기나 레이저를 이용한 내시경 절제술의 경우 조직이 파괴되기 때문에 문제 부위가 제거는 되지만 정확한 병변의 깊이를 확인하기는 어렵습니다. 하지만 내시경적으로 해당 부위 점막을 절제하는 내시경적 점막절제술이나 내시경 점막하 박리술을 하는 경우에는 병변의 절제와 함께 병변의 조직학적 평가를 내릴 수 있습니다.
